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中藥資源轉錄組分析操作指南 版權信息
- ISBN：9787547830130
- 條形碼：9787547830130 ; 978-7-5478-3013-0
- 裝幀：一般膠版紙
- 冊數：暫無
- 重量：暫無
- 所屬分類：>>
中藥資源轉錄組分析操作指南 本書特色
本書主要介紹了分子生藥學關鍵技術方法——重要資源轉錄組的理論、技術及研究方法。全書分為三篇：**篇系統論述了藥用植物轉錄組研究的現狀和主要技術方法，并重點探討了基于同源基因功能分化的藥用植物活性成分變異機制，以及功能性est-ssr標記的概念、優勢、應用范圍等；第二篇全面介紹了藥用植物轉錄組的操作流程，包括轉錄組數據的組裝、基因克隆及表達分析、數據庫使用及生物信息學分析、ssr標記開發等；第三篇主要介紹了藥用植物與真菌轉錄組研究的參考范例。本書從理論、技術、實際應用的角度全面介紹了藥用植物轉錄組這一關鍵技術方法，同時提供了可操作性強的實驗指導。本書不僅可以作為醫藥院校生藥專業、中醫院校中藥專業的本科生、研究生及教師的實驗教學用書，也可作為相關科研人員的參考書。
中藥資源轉錄組分析操作指南 內容簡介
本書主要介紹了分子生藥學關鍵技術方法 —— 藥用植物轉錄組的理論、技術及研究方法。全書分為三篇: **篇系統論述了藥用植物轉錄組研究的現狀和主要技術方法, 并重點探討了基于同源基因功能分化的藥用植物活性成分變異機制, 以及功能性EST—SSR標記的概念、優勢、應用范圍
中藥資源轉錄組分析操作指南 目錄
**篇理 論 篇一、 中藥資源轉錄組概述3（一） 轉錄組的研究目標3（二） 轉錄組的研究方法5（三） 中藥資源轉錄組研究現狀5（四） 中藥資源轉錄組研究展望12二、 同源基因功能分化與活性成分變異機制22（一） 同源基因的正確注釋是研究藥用植物活性成分變異的重要前提22（二） 重復基因的功能分化是形成藥用植物活性成分變異的基礎24（三） 藥用植物基因功能分化決定其活性成分的變異26三、 功能性estssr標記31（一） 功能性estssr的基本概念31（二） 功能性estssr的開發流程32（三） 功能estssr的優勢35（四） 功能性estssr標記在中藥資源中的應用36（五） 藥用植物功能性estssr標記展望38〖〗第二篇技 術 篇一、 轉錄組數據的組裝43實驗一樣品收集與保存43實驗二rna提取44實驗三mrna分離純化47實驗四solexa文庫制備49實驗五上機測序53實驗六轉錄組數據組裝59實驗七轉錄組數據功能注釋61二、 基因克隆及表達分析64實驗八基因克隆64實驗九基因表達分析71實驗十共表達分析80三、 數據庫使用及生物信息學分析84實驗十一核酸數據庫及其使用84實驗十二蛋白質數據庫及其使用91實驗十三代謝數據庫及其使用96實驗十四文獻數據庫及其使用101實驗十五ncbi序列數據的提交104實驗十六多序列對位排列分析109實驗十七系統發育分析112實驗十八核酸序列的分析和轉換117實驗十九基因開放閱讀框預測123實驗二十蛋白質理化性質預測129實驗二十一蛋白質亞細胞定位信號預測130實驗二十二蛋白質信號肽和跨膜結構域預測132實驗二十三蛋白質二級結構和三級結構預測135四、 ssr標記開發139實驗二十四ssr位點開發139實驗二十五ssr引物設計140實驗二十六基因組dna提取143實驗二十七瓊脂糖凝膠電泳145實驗二十八非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳147實驗二十九ssr數據統計149實驗三十ssr數據分析155〖〗第三篇實 踐 篇一、 金銀花轉錄組與質量評價標記篩選161二、 地黃根部轉錄組文庫的構建及響應連作障礙關鍵基因的篩選174三、 比較轉錄組學和代謝組學相結合研究丹參酮生物合成分子機制186四、 羅漢果果實轉錄組測序的研究209五、 基于轉錄組測序揭示適度干旱脅迫對甘草根基因表達的調控222六、 基于黃芩cdna文庫的功能estssr標記開發236七、 茯苓轉錄組ssr序列特征及其功能預測255八、 川西獐牙菜（藏茵陳）轉錄組ssr信息分析268九、 厚樸mva途徑相關基因鑒定及生物信息學分析288十、 三七香葉基香葉基焦磷酸合酶基因的克隆及表達分析301
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中藥資源轉錄組分析操作指南 作者簡介
黃璐琦，中國工程院院士，中國中醫科學院副院長，研究員。國家973計劃首席科學家，國家藥典委員會委員，國家生物物種保護專家委員會委員，國家中醫藥管理局中藥學學科帶頭人，主要從事中藥資源學和分子生藥學的研究。先后負責國家級和部局級課題20余項。曾獲國家科學技術進步二等獎3項，國家中醫藥管理局二等獎2項、三等獎1項，北京市科技進步二等獎2項。
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