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中藥資源轉(zhuǎn)錄組分析操作指南 版權(quán)信息
- ISBN：9787547830130
- 條形碼：9787547830130 ; 978-7-5478-3013-0
- 裝幀：一般膠版紙
- 冊(cè)數(shù)：暫無(wú)
- 重量：暫無(wú)
- 所屬分類(lèi)：>>
中藥資源轉(zhuǎn)錄組分析操作指南 本書(shū)特色
本書(shū)主要介紹了分子生藥學(xué)關(guān)鍵技術(shù)方法——重要資源轉(zhuǎn)錄組的理論、技術(shù)及研究方法。全書(shū)分為三篇：**篇系統(tǒng)論述了藥用植物轉(zhuǎn)錄組研究的現(xiàn)狀和主要技術(shù)方法，并重點(diǎn)探討了基于同源基因功能分化的藥用植物活性成分變異機(jī)制，以及功能性est-ssr標(biāo)記的概念、優(yōu)勢(shì)、應(yīng)用范圍等；第二篇全面介紹了藥用植物轉(zhuǎn)錄組的操作流程，包括轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的組裝、基因克隆及表達(dá)分析、數(shù)據(jù)庫(kù)使用及生物信息學(xué)分析、ssr標(biāo)記開(kāi)發(fā)等；第三篇主要介紹了藥用植物與真菌轉(zhuǎn)錄組研究的參考范例。本書(shū)從理論、技術(shù)、實(shí)際應(yīng)用的角度全面介紹了藥用植物轉(zhuǎn)錄組這一關(guān)鍵技術(shù)方法，同時(shí)提供了可操作性強(qiáng)的實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)。本書(shū)不僅可以作為醫(yī)藥院校生藥專(zhuān)業(yè)、中醫(yī)院校中藥專(zhuān)業(yè)的本科生、研究生及教師的實(shí)驗(yàn)教學(xué)用書(shū)，也可作為相關(guān)科研人員的參考書(shū)。
中藥資源轉(zhuǎn)錄組分析操作指南 內(nèi)容簡(jiǎn)介
本書(shū)主要介紹了分子生藥學(xué)關(guān)鍵技術(shù)方法 —— 藥用植物轉(zhuǎn)錄組的理論、技術(shù)及研究方法。全書(shū)分為三篇: **篇系統(tǒng)論述了藥用植物轉(zhuǎn)錄組研究的現(xiàn)狀和主要技術(shù)方法, 并重點(diǎn)探討了基于同源基因功能分化的藥用植物活性成分變異機(jī)制, 以及功能性EST—SSR標(biāo)記的概念、優(yōu)勢(shì)、應(yīng)用范圍
中藥資源轉(zhuǎn)錄組分析操作指南 目錄
**篇理 論 篇一、 中藥資源轉(zhuǎn)錄組概述3（一） 轉(zhuǎn)錄組的研究目標(biāo)3（二） 轉(zhuǎn)錄組的研究方法5（三） 中藥資源轉(zhuǎn)錄組研究現(xiàn)狀5（四） 中藥資源轉(zhuǎn)錄組研究展望12二、 同源基因功能分化與活性成分變異機(jī)制22（一） 同源基因的正確注釋是研究藥用植物活性成分變異的重要前提22（二） 重復(fù)基因的功能分化是形成藥用植物活性成分變異的基礎(chǔ)24（三） 藥用植物基因功能分化決定其活性成分的變異26三、 功能性estssr標(biāo)記31（一） 功能性estssr的基本概念31（二） 功能性estssr的開(kāi)發(fā)流程32（三） 功能estssr的優(yōu)勢(shì)35（四） 功能性estssr標(biāo)記在中藥資源中的應(yīng)用36（五） 藥用植物功能性estssr標(biāo)記展望38〖〗第二篇技 術(shù) 篇一、 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的組裝43實(shí)驗(yàn)一樣品收集與保存43實(shí)驗(yàn)二rna提取44實(shí)驗(yàn)三mrna分離純化47實(shí)驗(yàn)四solexa文庫(kù)制備49實(shí)驗(yàn)五上機(jī)測(cè)序53實(shí)驗(yàn)六轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)組裝59實(shí)驗(yàn)七轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)功能注釋61二、 基因克隆及表達(dá)分析64實(shí)驗(yàn)八基因克隆64實(shí)驗(yàn)九基因表達(dá)分析71實(shí)驗(yàn)十共表達(dá)分析80三、 數(shù)據(jù)庫(kù)使用及生物信息學(xué)分析84實(shí)驗(yàn)十一核酸數(shù)據(jù)庫(kù)及其使用84實(shí)驗(yàn)十二蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)及其使用91實(shí)驗(yàn)十三代謝數(shù)據(jù)庫(kù)及其使用96實(shí)驗(yàn)十四文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)及其使用101實(shí)驗(yàn)十五ncbi序列數(shù)據(jù)的提交104實(shí)驗(yàn)十六多序列對(duì)位排列分析109實(shí)驗(yàn)十七系統(tǒng)發(fā)育分析112實(shí)驗(yàn)十八核酸序列的分析和轉(zhuǎn)換117實(shí)驗(yàn)十九基因開(kāi)放閱讀框預(yù)測(cè)123實(shí)驗(yàn)二十蛋白質(zhì)理化性質(zhì)預(yù)測(cè)129實(shí)驗(yàn)二十一蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位信號(hào)預(yù)測(cè)130實(shí)驗(yàn)二十二蛋白質(zhì)信號(hào)肽和跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)132實(shí)驗(yàn)二十三蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)135四、 ssr標(biāo)記開(kāi)發(fā)139實(shí)驗(yàn)二十四ssr位點(diǎn)開(kāi)發(fā)139實(shí)驗(yàn)二十五ssr引物設(shè)計(jì)140實(shí)驗(yàn)二十六基因組dna提取143實(shí)驗(yàn)二十七瓊脂糖凝膠電泳145實(shí)驗(yàn)二十八非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳147實(shí)驗(yàn)二十九ssr數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)149實(shí)驗(yàn)三十ssr數(shù)據(jù)分析155〖〗第三篇實(shí) 踐 篇一、 金銀花轉(zhuǎn)錄組與質(zhì)量評(píng)價(jià)標(biāo)記篩選161二、 地黃根部轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)的構(gòu)建及響應(yīng)連作障礙關(guān)鍵基因的篩選174三、 比較轉(zhuǎn)錄組學(xué)和代謝組學(xué)相結(jié)合研究丹參酮生物合成分子機(jī)制186四、 羅漢果果實(shí)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的研究209五、 基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序揭示適度干旱脅迫對(duì)甘草根基因表達(dá)的調(diào)控222六、 基于黃芩cdna文庫(kù)的功能estssr標(biāo)記開(kāi)發(fā)236七、 茯苓轉(zhuǎn)錄組ssr序列特征及其功能預(yù)測(cè)255八、 川西獐牙菜（藏茵陳）轉(zhuǎn)錄組ssr信息分析268九、 厚樸mva途徑相關(guān)基因鑒定及生物信息學(xué)分析288十、 三七香葉基香葉基焦磷酸合酶基因的克隆及表達(dá)分析301
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中藥資源轉(zhuǎn)錄組分析操作指南 作者簡(jiǎn)介
黃璐琦，中國(guó)工程院院士，中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院副院長(zhǎng)，研究員。國(guó)家973計(jì)劃首席科學(xué)家，國(guó)家藥典委員會(huì)委員，國(guó)家生物物種保護(hù)專(zhuān)家委員會(huì)委員，國(guó)家中醫(yī)藥管理局中藥學(xué)學(xué)科帶頭人，主要從事中藥資源學(xué)和分子生藥學(xué)的研究。先后負(fù)責(zé)國(guó)家級(jí)和部局級(jí)課題20余項(xiàng)。曾獲國(guó)家科學(xué)技術(shù)進(jìn)步二等獎(jiǎng)3項(xiàng)，國(guó)家中醫(yī)藥管理局二等獎(jiǎng)2項(xiàng)、三等獎(jiǎng)1項(xiàng)，北京市科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)2項(xiàng)。
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